Объявление

Свернуть
Пока нет объявлений.

Волюметрия по МРТ

Свернуть
X
  • Фильтр
  • Время
  • Показать
Очистить всё
новые сообщения

  • Волюметрия по МРТ

    Подскажите, пожалуйста, _удобный_ софт (желательно бесплатный), для оценки объёма структур по МРТ. Причём таких структур, которые автоматической сегментацией выделить крайне сложно, т.е. чтобы была возможность руками выделять структуру сразу на срезах в трёх проекциях.

    В частности, нужно посчитать объёмы гиппокампов испытуемых по МРТ, а выделять в фотошопе гиппокампы на каждом срезе, а потом считать закрашенные пикселы слишком муторно и может привести к ошибкам.

    Хотелось бы также, чтобы софт поддерживал работу со слоями. Наподобие Фотошопа, но только для трёхмерных воксельных картинок. То есть, чтобы выделение можно было бы сохранить в файле отдельно от изображения мозга.

    P.S. Софт должен уметь читать хотя бы один из 2D-графических форматов, либо картинки в форматах Analize, DICOM или Bruker.

    P.P.S. Должна быть возможность работать с этой прогой на PC, т.е. операционка лишь DOS, Win или *NIX.

  • #2
    Re: Волюметрия по МРТ

    должно подойти MRICro

    http://www.sph.sc.edu/comd/rorden/ или www.mricro.com что то же самое.

    именно сейчас, правда их сервер "лежит"

    Там есть функции создания ROI вручную - от слайса к слайсу, можно спасти созданный ROI в том числе в файл формата Analyze.

    Прога абсолютно бесплатна, работает под виндами (не помню, но вроде есть версии и под другие ОС), возможности огромны (для неленивых).

    Про фотошоп в любом случае забудьте как про страшный сон

    Комментарий


    • #3
      Re: Волюметрия по МРТ

      А нет такой проги, чтобы она площадь ROI считала сразу по всем срезам?

      То,есть нужна не только картинка объёмной структуры, но и конкретная цифра в вокселах (или ещё лучше сразу в кубических миллиметрах) его объёма.

      Комментарий


      • #4
        Re: Волюметрия по МРТ

        [QUOTE=Stas]А нет такой проги, чтобы она площадь ROI считала сразу по всем срезам?

        Дык, она показывает объем...

        Комментарий


        • #5
          Re: Волюметрия по МРТ

          Кроме фотошопа я пользуюсь ещё прогой IRIS 2000 (http://www.cs.unc.edu/~stotts/COMP14...2000/userman/), но она жутко неудобная - выделять можно только полигонами, а например "карандашом" или "кистью", как в том же фотошопе, нельзя. Кроме того, она постоянно вылетает и зависает, теряя все данные, а также понимает лишь ужасный формат gipl. Зато поддерживает слои, даёт выделять в трёх измерениях и сразу строит 3D-картинку.

          Хотелось бы что-нибудь типа неё, но поудобнее и чтоб не только рисовала, но и считала объём и (в идеале) площадь поверхности выделенной структуры.

          Увы, но MRIcro ещё менее удобная, чем IRIS :(

          Комментарий


          • #6
            Re: Волюметрия по МРТ

            Сообщение от EchoKeeper
            Дык, она показывает объем...
            Ок. Спасибо! Значит, я плохо с ней разобрался. Буду пробовать.

            Комментарий


            • #7
              братва раскажите про волюметрию в мрт и кт что это и с чем есть ее?

              Комментарий

              Обработка...
              X
              yobit wp super cache yobit.net официальный сайт yobit.net freewallet bgogo